BCA 蛋白定量中的缓冲液干扰与排查

同一份蛋白,换了缓冲液后,BCA 测得的浓度明显变化;或者不含蛋白的缓冲液,加入工作液后也出现紫色。遇到这些情况,除了检查移液和仪器,更应先核对样品中的还原剂、金属螯合剂和其他添加物。

BCA 的读数来自显色反应。缓冲液既可能增加背景,也可能改变蛋白的显色响应。匹配空白是必要的对照,但不能保证消除所有干扰。本文讨论常规在 562 nm 测量的紫色 BCA 体系,其他改良配方应以各自说明书为准。

1 显色反应为什么会受到缓冲液影响

在碱性条件下,蛋白参与将二价铜 Cu²⁺ 还原为一价铜 Cu⁺。随后,两分子 BCA 与一个 Cu⁺ 形成紫色络合物,通过吸光度与标准曲线估算蛋白浓度。

这条反应路径也给干扰留下了入口:如果缓冲液中的成分能够还原铜,就可能产生并非来自蛋白的显色;如果某些成分络合了铜,或改变反应条件,蛋白的显色程度也可能变化。

图 1  常规 BCA 显色路径与干扰入口。原理示意,不表示具体反应速率或干扰强度。
图表可横向滑动查看。

图 1 常规 BCA 显色路径与干扰入口。原理示意,不表示具体反应速率或干扰强度。

因此,读数较高不一定代表蛋白更多,读数较低也不能只归因于蛋白损失。单凭颜色深浅,无法区分蛋白信号与化学干扰。

2 先检查这三类成分

还原剂。 DTT、β-巯基乙醇等可干扰常规 BCA 反应,甚至在没有蛋白时产生显著显色。检查时要记录具体名称和实际浓度,不能只写“加了还原剂”。使用标注为还原剂兼容的配方,也仍需核对它覆盖哪些物质、浓度与操作条件。

金属螯合剂。 EDTA 等成分可影响铜参与反应,进而改变显色。这里不宜简单得出“含 EDTA 就不能用 BCA”的结论:影响程度与浓度、试剂配方及样品和工作液的比例有关,应查对应方法的兼容性资料。

其他添加物和复杂基质。 去垢剂、糖类、强酸强碱,以及多组分裂解液或培养基,都需要逐项检查。某些 BCA 配方对部分去垢剂有较好耐受,并不代表任意浓度、任意混合物都适用。各组分单独低于某个限值,也不能代替对完整样品基质的验证。

3 兼容性表中的浓度要先看定义

使用兼容性表前,先确认四件事:试剂名称和版本、管法还是板法、样品与工作液的比例,以及表中浓度指的是加入工作液前的样品,还是混合后的反应液。

如果限值按“蛋白样品中的浓度”给出,就应与实际加入反应的样品比较。不能先把它除以反应混合的稀释倍数,再据此判断兼容,否则相当于把同一次稀释重复计算。

兼容性表通常还限定了测试蛋白、蛋白浓度和允许偏差。它适合帮助筛选方法,不能自动成为本实验的验收标准。尤其在低蛋白浓度或复杂混合基质下,应补做实际验证。

4 扣了空白为什么仍可能不准

若标准品在水中、样品在含添加物的缓冲液中,两者的显色环境不同。能获得合适的无蛋白基质时,宜使空白、每个标准点与待测样品中的相关缓冲组分保持一致,并让它们经历相同处理。不要在稀释标准蛋白时,让干扰物浓度也跟着标准梯度变化。

但扣空白主要处理背景差异。如果干扰物与蛋白共同存在时的显色并非两者单独显色的简单相加,减去“不含蛋白的缓冲液”读数,仍可能留下偏差。反过来,空白没有明显颜色,也不能排除基质抑制了蛋白显色。

因此,应把空白结果与稀释一致性、加标回收等证据一起判断。反复做仪器归零,无法修复反应体系中的不相容。

5 稀释必须同时照顾干扰物和蛋白

稀释可能降低干扰物浓度,也会降低蛋白浓度。前提是所用稀释液适合样品,并且不会把待降低的干扰物重新补回。用同样含有高浓度 DTT 的缓冲液稀释,就不能按倍数降低 DTT 浓度。

例如,假设一份样品含蛋白 0.80 mg/mL、DTT 2.0 mM,用不含 DTT 的适用稀释液做 4 倍预稀释后,两者分别变为 0.20 mg/mL 和 0.50 mM。这里的 4 倍指取 1 份样品、补足至 4 份总体积。这只是稀释计算示例,0.50 mM 不是本文推荐的兼容限值。

图 2  预稀释同时降低蛋白与 DTT 的浓度。按原液蛋白 0.80 mg/mL、DTT 2.0 mM 计算;稀释液不含 DTT。各点是计算值,不是实测数据,也不表示兼容限值或有效定量范围。
图表可横向滑动查看。

图 2 预稀释同时降低蛋白与 DTT 的浓度。按原液蛋白 0.80 mg/mL、DTT 2.0 mM 计算;稀释液不含 DTT。各点是计算值,不是实测数据,也不表示兼容限值或有效定量范围。

能否采用这个倍数,要同时满足:干扰物降到该方法可接受的水平,蛋白仍处于已验证的定量区间,且样品没有因稀释而析出或发生明显损失。如果两者没有可用的交集,就不应继续靠加大稀释倍数解决。

比较不同预稀释条件时,先把有效区间内的回算浓度乘以相应预稀释倍数,再比较原液结果。如果标准曲线本来就用“加工作液前的标准浓度”建曲,不要再额外乘一次加入工作液造成的稀释倍数。

6 用一组小验证决定下一步

先留全配方。 记录裂解或洗脱缓冲液、临测前加入的添加剂、最终浓度、试剂批号、样品与工作液比例、孵育温度及读数时间。标准与样品应同步处理;BCA 显色会随条件和时间变化。

再做有信息量的对照。 在不超出方法适用条件的前提下,比较匹配基质的反应空白、已知蛋白对照,以及同一样品的两个或更多预稀释条件。各条件均设置独立反应重复,不只重复读取同一份反应液。

必要时检查加标回收。 向样品中加入已知量的适用蛋白标准,比较加标前后测得的增量与理论加入量。计算前应校正加标带来的体积变化,并保持两组基质尽可能一致。回收率判断范围应依据实验目的和方法验证预先确定,不套用一个通用百分比。

不同稀释倍数的原液回算值接近,是有用的支持证据,却不能独立证明准确;BSA 加标回收合适,也不保证样品中所有蛋白都与 BSA 响应相同。如果加标发生在前处理之后,这项检查也不能评价此前的蛋白损失。需要更高准确度时,可结合合适的参考材料或独立方法验证。

如果干扰仍无法控制,可考虑经验证的换液、脱盐或沉淀处理,或选择更适合该基质的定量方法。前处理可能造成蛋白损失,必须检查回收。改用 Bradford 也要重新核对去垢剂兼容性和蛋白响应差异,不能把换方法当作自动消除干扰。

相关产品与应用

光速进化 Evolstorm 的 NANO X1 平台列有 BCA-562、Bradford 和 Lowry-650 等蛋白比色法。选择具体方法时,建议先整理样品组成、预期浓度与试剂条件,再核对对应仪器配置和软件版本的适用要求。

无论使用哪一种读数平台,可靠的 BCA 结果都离不开相容的反应体系、合适的标准和必要的对照。仪器负责读取吸光度,实验设计负责判断这份信号能否代表目标样品的蛋白浓度。

申请试用 NANO X1

目前仅开放中国大陆地区试用。

主要检测需求